As primeiras atividades relacionadas à Fitopatologia na UFV tiveram início em 1929 com o Dr. A.S. Muller. Ele foi o responsável pela instalação e desenvolvimento da Seção de Fitopatologia da antiga Escola Superior de Agricultura e Veterinária (ESAV), que precedeu a atual Universidade. São de sua autoria também os primeiros estudos sobre as principais enfermidades de cultivos da região, assim como o herbário micológico, com registro internacional.

Após inúmeras transformações administrativas ao longo dos anos, em 1978 o Departamento de Fitopatologia da UFV foi criado oficialmente, junto com a instalação do Centro de Ciências Agrárias. O professor Geraldo Martins Chaves foi o primeiro chefe do Departamento e seu grande incentivador. Atualmente as disciplinas de Fitopatologia são ministradas para alunos dos cursos de Agronomia, Engenharia Agrícola e Ambiental, Engenharia Florestal e Zootecnia.